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代谢物Biomarker筛选


代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转录组或者蛋白质组要快得多,这使得代谢组在疾病诊断与治疗反馈、以及药物的研发领域有很好的应用。"广泛靶向代谢组"是一种全新的代谢物检测定性、定量检测技术,它结合了非靶向、靶向的优点,将高通量、高灵敏度和定量的优点集合于一起,特别适合检测中低丰度代谢产物,是发现新代谢物Biomarker的最适方法。


应用领域

新的代谢物Biomarker发现;

药物、毒理等效用评价。

  
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技术参数


样品要求

1.  样品类型
血清/血浆:500ul/例,不得低于200ul/例,不能反复冻融。如果用血浆请用肝素钠抗凝。血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载干净的离心管中,再离心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.5ml-80度冻存寄送,不得反复冻融。

尿液:1ml/例,可多取一点。尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10ul)质量体积为1/100w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送,不得反复冻融。

组织:100 mg/样品,钻孔离心管分装,获取后立即放置液氮中,-80度冻存寄送,不得反复冻融。

2.  生物学重复

临床标本设计不低于10例平行样品

3.  保存和运输

样品请置于 1.5 ml 管或合适管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用 Parafilm 封口。建议在运输前将所有样品管固定于 50 ml 带盖离心管中,再将 50 ml 管放在封口袋中。干冰运输,不能反复冻融。

项目周期

70个工作日

分析内容

1. 对原始数据进行去背景噪音及低质量的处理;

2. 数据产出统计及数据的成分和质量评估;

3. 代谢物鉴定注释;

4. 代谢物定量分析;

5. 不同时间、组织间代谢物的积累模式分析;

6. 差异代谢物分析;

7. 差异代谢物通路富集分析;

8. 表型相关核心代谢通路筛选分析;