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数字表达谱





       数字表达谱(Digital Gene Expression Tag ProfilingDGE)是利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况,可以同时进行全基因组范围的基因定量分析,研究不同样本之间的差异表达情况,可广泛应用于农业性状、生理调控、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。相比于转录组测序,DGE表达谱需要的数据量更少,更节约成本,适合大样本研究。














  
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技术参数


样品要求

RNA总量≥1.5μg, 浓度≥80 ng/μl

文库类型

小片段RNA文库

测序平台和类型

HiSeq PE150

测序策略

10M clean reads

项目周期

30个工作日

分析内容

测序质量评估

参考基因组比对

重复性分析

差异基因分析

条件特异表达分析

主成分分析

差异基因GOKEGG富集分析

蛋白互作分析