027-59760427800

155-2714-3378

10703423(小妮-UniqueGene

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全长录组测序


    采用PacBio SMRT测序技术,平均10-15Kb读长的数据可以轻松跨越从5’末端到3’-Poly A的完整转录本,可以准确鉴定异构体,精确分析可变剪接、融合基因、等位基因表达,挖掘新基因。








  
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技术参数


样品要求

RNA总量≥20μg,浓度≥180 ng/μl

文库类型

1-2kb2-3kb>3kb三个文库

测序平台和类型

PacBio Sequel

测序策略

每个文库1Cell

项目周期

60个工作日

分析内容

有参考基因组

无参考基因组

1.数据质控、转录本分类

2.转录本聚类与校正

3.与参考基因组比对

4.SNP分析

5.SSR分析

6.可变剪切分析

7.融合基因分析

8.新基因预测

9.lncRNA预测

10.蛋白编码框预测

11.作为参考序列,定量分析

12.基因差异表达分析和富集分析

1112需结合二代测序结果分析)

1.数据质控、转录本分类

2.转录本聚类与校正

3.SNP分析

4.SSR分析

5.转录本注释

6.lncRNA预测

7.蛋白编码框预测

8.作为参考序列,定量分析

9.基因差异表达分析和富集分析

89需结合二代测序结果分析)