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广泛靶向代谢组


  广泛靶向代谢组Widely Targeted Metabolome)技术平台建立了LC-MS/MS代谢物数据库,区别于现有代谢物检测方法,整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。同时,结合气-质联用(GC-MS)和核磁共振(NMR )无创检测手段,进一步丰富了初生代谢产物和次生代谢物的检测和鉴定的多样性。


应用领域

批量检测和鉴定次生代谢物质

检测和鉴定中低丰度物质

结合转录组和基因组学数据开展生物学研究

建立物种代谢物数据库

  
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技术参数


样品要求

1.样品类型

a.细胞,取样后离心,去除培养基,立即放人液氮中,之后-80°保存;

b.叶片、茎、花等,取下后立即放人液氮中,之后-80°保存; c.果实的果肉、果皮等,如果野外现场不具备分离条件,需尽快(30 min内)转移至室内,分离样品放入液氮中,之后-80°保存。

2.混合取样:

每份样品混合来自至少3株以上的组织。以水稻叶片为例:取同一时期,表型基本一致的同一个部位的1片叶片,同时取6株,放到10ml离心管中,并迅速放入液氮中。

3.样品重量和重复:

每份样品取样鲜重3-5g(干重不低于1g)。

准备2-6份生物学重复,代谢组通常做3个以上重复,剩余备份。

4.储存和运输:

离心管,盖好盖子,管壁上钻直径1-2mm孔若干个,以便于冷冻干燥。干冰运输,不能反复冻融

项目周期

70个工作日

分析内容

1. 对原始数据进行去背景噪音及低质量的处理;

2. 数据产出统计及数据的成分和质量评估;

3. 代谢物鉴定注释

4. 代谢物定量分析

5. 不同时间、组织间代谢物的积累模式分析;

6. 差异代谢物分析;

7. 差异代谢物通路富集分析;

8. 表型相关核心代谢通路筛选;