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参转录组


    采用高通量测序技术,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序,与参考基因组进行比对,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及SNP(单核苷酸多态性),提供最全面的转录组信息。是目前深入研究转录组复杂性的强大工具,已广泛应用于多种研究领域









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技术参数


样品要求

RNA总量≥4μg, 浓度≥180 ng/μl

文库类型

普通文库/ 链特异性文库

测序平台和类型

HiSeq PE150

测序策略

3G6G12G clean data (视项目需求)

项目周期

30个工作日

分析内容

与参考基因组比对

新转录本预测

可变剪切分析

SNP分析

InDel分析

基因表达水平分析

差异基因分析

GO/KEGG富集分析

蛋白互作网络分析

转录因子注释