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宏基因组学


宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,研究对象为特定环境中的全基因组DNA,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,通过高通量测序,获得单个样品大数据,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。


宏基因组测序首先能够获得特定环境中微生物物种的组成及丰度信息;其次进行物种基因组组分分析,并进行相关功能及代谢通路注释,从而获得全面的环境微生物基因组基本信息。另外根据研究目的的不同设置不同分组,进而发现不同样品间及组间差异,进而深度挖掘具有应用价值的基因资源,进一步探索环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互关系。

  
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技术参数


样品要求

DNA总量≥3μg,浓度≥50 ng/μl

文库类型

300-500bp小片段文库

测序平台和类型

Hiseq PE150

指标

5G raw data

项目周期

30个工作日

标准分析内容

测序数据质量评估

基因预测

物种、功能注释

ARDB

CAGMLG分析

CNV(copy number variation)

噬菌体预测及分析